Shōgun spielt im Japan des Jahres 1600, am Vorabend eines jahrhundertprägenden Bürgerkriegs. Lord Yoshii Toranaga kämpft um sein Leben, während seine Feinde im Regentenrat sich gegen ihn verbünden. Dann wird ein mysteriöses europäisches Schiff in einem nahegelegenen Fischerdorf gestrandet aufgefunden.
