'스타트렉: 보이저'는 24세기 캐서린 제인웨이 함장이 U.S.S. 보이저호를 타고 떠나는 모험을 다룬다. 커크나 피카드 함장의 우주선보다 작지만 빠르고 강력하며, 행성 착륙이 가능한 스타플릿의 첨단 함선이다. 제인웨이의 첫 임무는 알파 사분면에서의 마지막 임무가 될 예정이었으나, 반란군 마키스 함선을 포획하려던 중 강력한 외계 기술에 의해 두 함선 모두 머나먼 델타 사분면으로 끌려간다. 지구에서 7만 광년 떨어진 곳에 고립된 제인웨이는 마키스 승무원들을 설득하여 스타플릿 승무원들과 함께 연방 공간으로 돌아가는 긴 여정에 동참하게 한다.
