FBI-agent Seeley Booth teamer opp med rettsmedisinsk antropolog Dr. Temperance «Bones» Brennan for å løse noen av de mest forvirrende og bisarre forbrytelsene. Booth baserer seg på spor fra levende vitner og mistenkte, mens Brennan samler bevis fra de døde, takket være sin unike evne til å lese spor i ofrenes bein.