FBI: International følger eliteagentene i Federal Bureau of Investigations internasjonale Fly Team. Med hovedkvarter i Budapest reiser de verden rundt med oppdrag om å spore opp og nøytralisere trusler mot amerikanske borgere uansett hvor de befinner seg. Uten tillatelse til å bære våpen, stoler Fly Team på etterretning, rask tenkning og ren muskelkraft når de setter livene sine på spill for å beskytte USA og dets folk.
