Lioness, inspiriert von einem realen US-Militärprogramm, folgt Joe, die versucht, ihr Privat- und Berufsleben als Speerspitze der CIA im Kampf gegen den Terrorismus zu vereinbaren. Das von Kaitlyn Meade und Donald Westfield überwachte Lioness-Programm rekrutiert die aggressive Marine-Soldatin Cruz, um verdeckt an Joes Seite unter den Drahtziehern des Staatsterrorismus zu operieren und so die Bemühungen der CIA zu unterstützen, den nächsten 11. September zu verhindern.