Mr. Robot følger Elliot, en ung programmerer som jobber som cybersikkerhetsingeniør på dagtid og som selvoppnevnt hacker om natten. Elliot befinner seg ved et veiskille når den mystiske lederen av en underjordisk hackergruppe rekrutterer ham til å ødelegge firmaet han er betalt for å beskytte. Drevet av sin personlige overbevisning, kjemper Elliot for å motstå sjansen til å felle de multinasjonale toppsjefene han mener styrer (og ødelegger) verden.