Atlantis, duizenden jaren geleden gebouwd door de hoogontwikkelde Ouden, dient als thuisbasis voor een elite-expeditie vanaf de Aarde. Deze moedige militaire commandanten en wetenschappers springen door de Stargate van de stad om de wonderbaarlijke Pegasus-melkweg te verkennen en de verraderlijke Wraith te bestrijden, die koste wat het kost de controle over Atlantis willen.
