Akcja „Shōguna” rozgrywa się w Japonii w 1600 roku, u progu wojny domowej, która zdefiniuje stulecie. Lord Yoshii Toranaga walczy o życie, gdy jego wrogowie z Rady Regentów jednoczą się przeciwko niemu, a w pobliskiej wiosce rybackiej zostaje znaleziony tajemniczy europejski statek.
